在2019年全国大学排行榜中，南京农业大学排名第四十七位。重点学科为作物栽培学与耕作学，作物遗传育种，蔬菜学，土壤学，植物病理学，农业昆虫与害虫防治，预防兽医学，农业经济管理。
南京农业大学全国排名第四十七位南京农业大学坐落于钟灵毓秀、虎踞龙蟠的古都南京，是一所以农业和生命科学为优势和特色，农、理、经、管、工、文、法学多学科协调发展的教育部直属全国重点大学，是国家“211工程”重点建设大学、“985优势学科创新平台”和“双一流”一流学科建设高校。
南京农业大学优势专业排名在南京农业大学所有专业中，农业资源与环境专业排名第一；作物学专业排名第二；植物保护、兽医学专业排名第三。
| 序列 | 专业名称 | 专业排名 |
| 1 | 农业资源与环境 | 1 |
| 2 | 作物学 | 2 |
| 3 | 植物保护 | 3 |
| 4 | 兽医学 | 3 |
| 5 | 科学技术史 | 4 |
| 6 | 园艺学 | 4 |
| 7 | 食品科学与工程 | 5 |
| 8 | 水产 | 5 |
| 9 | 农林经济管理 | 6 |
| 10 | 畜牧学 | 6 |
| 11 | 草学 | 9 |
| 12 | 公共管理 | 10 |
| 13 | 图书情报与档案管理 | 12 |
| 14 | 农业工程 | 12 |
| 15 | 生物学 | 16 |
| 16 | 生态学 | 23 |
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