博士后流动站(14个)：中国语言文学、作物学、兽医学、植物保护、农业工程、化学、畜牧学、中国史、数学、水利工程、草学、生物学、中西医结合、马克思主义理论博士后流动站。
国家重点学科(2个)：作物栽培与耕种学、预防兽医学
国家重点培育学科(1个)：动物遗传育种与繁殖
2、扬州大学重点专业名单国家双语教学示范课程：有机化学
国家级特色专业 ：动物医学、农学、化学、数学与应用数学、水利水电工程、汉语言文学。
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