学院原为新疆财经大学商务学院，2019年12月26日，经教育部批准转设为新疆科技学院。
学校历程
新疆财经大学商务学院
2004年，新疆财经大学商务学院成立，是经教育部批准成立的全日制普通本科院校；
2016年，新疆财经大学商务学院迁址库尔勒办学。
新疆科技学院
2019年10月，经全国高校设置评议委员会专家考察和评议，拟转设为新疆科技学院(公示期已结束)。
2019年12月，教育部复函新疆维吾尔自治区人民政府，同意新疆财经大学商务学院转设为新疆科技学院，学校标识码为4165013561；同时撤销新疆财经大学商务学院的建制。
