学校旧时原为汝贵书室，后来改为私立普育学校，始建于二十世纪30年代，80、90年代先后由村、镇和区集资二百六十多万元人民币改建而成。
在漫长的岁月里，曾经数易校名，直到1956年才定名为南漖小学。
南漖小学地处聚龙坊“龙腹”之处，环境安静宜人，文化历史底蕴丰富。
南漖小学占地面积4665平方米；建筑面积2416平方米。
学校布局基本合理，校园绿树成荫，鸟语花香，学校也因环境洁净幽美和校风纯正而蠃得社区美誉，2010年被评为广州市绿色学校。
近年来，在上级部门的关心和支持下，学校先后通过创建教育强区、创建规范化学校以及荔湾区中小学素质教育三年规划验收。
学校的校容校貌发生了翻天覆地地变化，由一所破烂不堪的村办小学变成了一所环境优美整洁的规范化学校；由一所专用室场严重缺少，设施设备严重滞后的小学变成了一所拥有电脑室、多媒体电教室、科学实验室等专用教室21间，设施设备先进的学校。
在创强过程中，拆除了旧教学楼和原教师宿舍两栋危房，对南北两栋教学楼和操场、校门、围墙进行了维修和综合改造，总投资达204万多；多媒体平台进课室、学校信息化工程等投资达72万多。
在规范化学校建设过程中，又投资了56万多，使学校的各个方面又上了一个台阶，为我校的全面工作和学生的全面发展创设优越条件。
南漖小学传承龙舟文化，为了凸显龙舟文化，EBBR分析南漖文化，决定将项目定位为聚龙之精魂，打造一所龙舟人文特色较为浓厚的品牌小学，一所中国华南地区广州市著名的，具悠久历史和文化传统的国际化、规范化的，学术研究型的，师生向往的，本土民族特色全日制小学。
在标志设计上面各个方案都围绕着龙舟文化和水元素来进行，而校门口也将配合这个主题进行改造。
