证书性质不同，初级会计师是一种会计专业的职称，注册会计师是指通过注册会计师执业资格考试并取得注册会计师证书在会计师事务所执业的人员。考试科目不同，初级会计的考试科目包括《经济法基础》和《初级会计实务》，注册会计师考试科目是会计、审计、税法、财务成本管理、经济法、公司战略与风险管理。
初级会计师是职称类的考试，更加偏向的是会计的方向。注册会计师是资格类的考试，更加偏向的是审计类的方向。
二者有很大的不同，初级会计的考试方向更加偏向的是理论的内容，对教材的内容考查的更加深入一点。是一个循序渐进的过程，注册会计师则不同，注册会计师是需要5年通过6科，考试的方向更加偏向的是实务的方向，对之后的工作有很大的一个的影响。
