注册会计师是准入类考试，税务师是水平评价类考试。税务师考试更加注重“税”，考试中也需要考生掌握一定的会计知识，去解决与“税”有关的问题。而注会则更为注重会计类的知识。
税务师的涉税鉴证是依据税收法律、法规，对被鉴证单位涉税事项的真实性、合法性发表意见，从而为税收征纳双方提供合法、准确的涉税信息，其执业行为的目的是对国家税收利益和纳税人合法权益负责。
注册会计师的财务审计，是依据会计法律、法规，对被审计单位财务报表是否真实和公允发表意见，其执业行为的目的是对股东等投资者负责。由于执业目的不同，注册会计师同时提供“审计业务”和“非审计业务”，可能会造成审计质量的下降。
