南通重点高中有江苏省海安高级中学、江苏海门中学、江苏省如东高级中学、江苏省南通中学、江苏省启东中学、江苏省如皋中学、江苏省南通第一中学等。
江苏省南通第一中学江苏省南通第一中学创建于1919年，其前身是一所英化私立学校。1956年，学校更名为“南通第一中学”，并被定为南通市属重点学校。1980年，被江苏省教育厅定为江苏省属重点中学。1990年，学校通过省教委对重点中学的检查验收。1998年，学校被认定为南通市区首家达标的“国家级示范性普通高中”。2004年，学校作为国家级示范性普通高中被转评为江苏省首批四星级普通高中。
江苏省海安高级中学江苏省海安高级中学前身为"海安私立紫石中学"，1939年秋由爱国人士、原江苏省省长韩国钧（字紫石）先生创办。1997年8月，更名为"江苏省海安高级中学"。1999年4月，江苏省海安高级中学被江苏省教委正式确认为"国家级示范高中"。学校曾获得江苏省德育先进学校、江苏省教育科学研究试验基地、全国文教先进单位、全国群众体育先进单位、西交利物浦大学优质生源基地等荣誉。
