辛丑条约的签订，不仅给中国人民带来了沉重负担，还损害了国家主权。从此，清政府完全成为了帝国主义统治中国的工具，而俄国则在用其它条约获得中国的东北的领土。
19世纪末帝国主义列强激烈争夺和瓜分中国，造成中国空前严重的民族危机。这种危机感促成了人们的觉醒，救亡图存成了当时最紧迫的要求。
“辛丑条约”后，中国要负担巨大的赔款，百姓承受的苦难更深。此外，外国获准在中国首都和一些要塞地方驻军，此举为1937年日本挑起卢沟桥事变埋下祸根。这场动乱也使中国的立宪派和国人看清了清政府的腐败无能，因而纷纷支持反清的革命运动。
清朝4亿5千万两的赔偿金额，若包括利息支付则高达8亿5千万两，但当时清朝政府预算不到1亿两，导致海关税收也被作为赔偿的来源。平均当时中国人每人须赔偿一两，在法文合约版本赔偿金额的是450百万，而中文版本是450兆两（当时“兆”指的是“百万”而非“万亿”）。
清朝履行支付造成后来清末新政受到影响，且为防止被侵略，国家投资以军备优先，使北洋军统帅袁世凯权势大增。而依靠列国及外国资本银行的借款，加强对外国的依赖，民众在增税压力下及穷困生活对清朝感到不满，最终加速清朝灭亡。
