中药作用的两重性是指治疗作用与不良反应。中药对机体既可产生治疗作用又可产生不良反应，中药的有毒无毒、十八反、十九畏、禁忌等，强调了中药的不良反应和毒性。
中药传统口服给药方法显示中药具有毒性低，不良反应少的特点。但某些中药的毒性严重影响了其临床应用，如朱砂长期应用引起慢性汞中毒，雷公藤长期应用引起生殖系统损伤等。
中药的采收时节和方法对确保药物的质量有着密切的关联。因为动植物在其生长发育的不同时期其药用部分所含有效及有害成分各不相同，因此药物的疗效和毒副作用也往往有较大差异，故药材的采收必须在适当的时节采集。
