持有执业药师证书的人员可以在药店执业、售药，可以评定职称，可以升职加薪或自己开店，可以申请个税专项扣除。根据相关规定，有执业药师证才可以为患者提供药品咨询和药事服务，有执业中药师证才可以卖中药饮片，零售药店和医院药房营业期间必须由执业药师指导用药。
专业技术人员取得执业药师职业资格，可认定其具备主管药师或主管中药师职称，并可作为申报高一级职称的条件，单位根据工作需要择优聘任。
药店、药企方面，普通职员一般是鼓励考证，有证有奖金或者加薪；管理者和老板，或者法人，新GSP明确规定必须要有证，否则各种撤销资格。企业质量负责人应当具有大学本科以上学历、执业药师资格和3年以上药品经营质量管理工作经历；企业质量管理部门负责人应当具有执业药师资格；企业法定代表人或者企业负责人应当具备执业药师资格。
2019年起，在个税专项扣除的继续教育里，执业药师证书已成为个人所得税扣除项了，可申请每年3600元的个税专项扣除。
