学费不同（专硕学费高于学硕）、学制不同（学硕是全日制学习，专硕是全日制学习和半脱产两种形式）、报考要求不同（学硕对工商管理等专业有相关工作经验要求，专硕对公共管理硕士等专业有相关工作经验要求）、培养目标不同（专硕以专业实践为导向，学硕以其学术研究为导向）。
学费不同：学硕一年的学费为8000—10000元。专硕学费则较高，为8000——15000元。但是，学硕基本都是三年制，专硕只有两年，因此，学费总额相差不大。
学制不同：学硕的学制是全日制学习，为3年；专硕的学制是全日制学习和半脱产两种形式，学制2-3年。
报考要求不同：除了工商管理等专业之外，大多数学硕对报考者没有工作经验要求，这就意味着无论是应届生还是往届生都可以报考。
专硕个别专业如公共管理硕士等要求考生必须具备相关工作经验。
培养目标不同：专硕以专业实践为导向，重视实践和应用，培养在专业和专门技术上收到正规的、高水平训练的高水平人才。
学硕按学科设立，以其学术研究为导向，偏重理论和研究，培养大学教师和科研机构研究人员。
