福建中医药大学现在有2个校区，分别为福建中医药大学旗山校区、屏山校区。地址分别是：福建省福州市闽侯县上街镇上街华佗路1号；五四路282号。
福建中医药大学校区地址及简介福建中医药大学旗山校区；地址：福建省福州市闽侯县上街镇上街华佗路1号。
福建中医药大学屏山校区；地址：五四路282号。
学校拥有两个校区，共占地1030亩，各类建筑总面积32万多平方米，教学科研仪器设备总值2.5亿多元，纸质图书120万册、电子图书73万册。学校各类设施优良，配备了现代化的教学、科研、行政、生活等设施，建设了富有中医药文化气息的人文景观，是一个环境优美、文化浓郁的校园，被授予“全国中医药文化建设先进单位”和“全国绿化模范单位”荣誉称号。
福建中医药大学校师资力量学校现有教职医护员工（含四所直属附属医院）3000多人，其中具有高级职称的专业技术人员700多人；拥有1名国医大师、3名全国名中医、2名国家中医药传承与创新“百千万”人才工程（岐黄工程）岐黄学者，5名教育部教学指导委员会委员（其中中医学类专业教学指导委员会副主任委员1名、中西医结合类专业教学指导委员会副主任委员1名）；拥有一批国家和卫生部有突出贡献的中青年专家、国务院特殊津贴专家、国家级名老中医学术继承人指导老师、全国百名杰出青年中医、全国优秀教师等。
