根据《国家教育委员会、国家计划委员会、财政部关于印发〈高等学校培养第二学士学位生的试行办法〉》((87)教计字105号)精神和相关资料，双学位与第二学士学位又以下区别：
一、报考条件不同。
第二学士学位主要招收大学本科毕业生并获得学士学位的在职人员(含实行学位制度以前的大学本科毕业生)。也招收少量大学本科毕业获得学士学位的应届毕业生(含按学分制提前完成学业并获得学士学位的学生)。在职报考要经单位批准，经过必要的资格审查与入学考试、考核，择优录取。第二学位修业年限一般限定为两年，有的专业如中医学专业为三年。双学位只招全日制在校本科学生，且在未取得第一学位即可跨专业选学第二学位课程。通过成人高考和自学考试获得本科学历的人，不能报考第二学士学位。如果想报考第二学士学位，需参加由国家学位办组织的学士学位考试，获得学士学位后再报名参加第二学士学位考试。
二、审批权限不同。
双学位由学校自己制定批准;第二学士学位需要教育部审批。只有教育部批准设置第二学士学位专业的高等学校才有权颁发第二学士学位证书。
三、发证不同。
双学位毕业证是在一个毕业证上注上两个专业名称，双学位证是在一个学位证上注上两个学位名称;而第二学士学位是另外发毕业证书和学位证书。
四、毕业待遇规定不同。
国家对双学位毕业生没有明确的毕业待遇规定;而国家对第二学士学位毕业生明文规定“获得第二学士学位者，毕业后起点工资与研究生班毕业生工资待遇相同”。
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