学历性质不同：专插本是广东省统招专升本考试，属于全日制学历，本科是第一学历，而自考本科属于成人教育学历，本科是第二学历。学制不同：专插本还需要继续到本科院校修读2年学业，实施3+2的学制，而自考则没有固定学制，几年考过就可以几年申请毕业拿证。
学习方式不同：自考本科可以完全依靠考生自己学习，也可以报社会助学班，而专插本则必须要全天在校上课学习，接受全日制的学习模式。
入学考试不同：自考不需要经过入学考试，只需入学后参加单科统一考试，而专插本则需要参加入学考试，考试科目为两门，分别为英语和专业基础课。
毕业证书颁发单位不同：自考本科的毕业证书颁发单位是高等教育自学考试委员会和毕业院校，而专插本的毕业证书与全日制普通本科是一样的，由毕业院校颁发。
