两所大学都在上海，都不是211，但各有特色。上海海关学院是财经类大学，上海工程技术大学是理工科大学。根据综合排名，上海工程技术大学位居榜首；按高考分数，上海海关学院分数更高。哪一个更好是见仁见智的问题。如果让我选择，我可能会选择上海海关学院。
上海海关学院是中国唯一一所以“海关”命名的大学，直属海关总署。2018年校友会排名全国第505位，全省第24位。行业特点很有特色，像这样的大学就业还是不错的，比如中国季良大学，南京审计大学，外交学院，北京语言大学，北京印刷学院，北京物资学院，中国民航大学，上海立信会计金融学院等上海海关学院虽然在这个二批招生，但是分数线比这个高很多。以2018年河北理科为例，其提档线为559分，也可见其受欢迎程度。
上海海关学院最好的专业是海关管理，是全国集散控制点特设专业，也是全国最好的，其次是对外经济贸易大学。国家专业是税务，国家专业的建设点是法学和税务，审计专业也不错。
上海工程技术大学综合实力较强，是教育部“卓越工程师教育培养计划”高校之一。2018年校友会排名第270位，全省排名第16位。其排名远超上海海关学院，但高考分数低很多。以2018年河北理科为例。其提档线为527分，比上海海关学院低32分。
上海工程技术大学的国家级特色专业是工商管理、交通运输、艺术设计，以及现代汽车应用工程、服装设计与工程、社会保障、天然农药化学工程、能源科学与工程等上海市重点学科。是理工科大学，最热门的专业是理工科，比如车辆工程、电气工程及其自动化、机械设计制造及其自动化、机械工程及其自动化、飞行技术、材料成型及控制工程、服装设计与工程、工程管理、劳动与社会保障、摄影等。
一般来说，如果想从事海关工作，首选是上海海关学院。当然，分数要够高。如果你想学工科，你的首选是上海工程技术大学。这涉及到个人兴趣和特长。不管分数如何，不管怎么选，都有利有弊。上海海关学院行业特色鲜明，入关方便，但就业范围太窄，选择余地太小。上海工程技术大学的专业就业面更广，但是国内理工科专业的好大学也不少。它能在哪里出现？竞争太激烈了。总之各有利弊，看个人需求。
