重庆医科大学可以说是重庆最强的独立医科大学了，但是强大如云。综合实力在重庆医科大学以上的独立医科大学有中国医科大学、南方医科大学、南京医科大学、首都医科大学、哈尔滨医科大学、广州医科大学。为了让重庆医科大学更好的发展，重庆市督促重庆医科大学与复旦大学开展深入的交流与合作。
要知道复旦大学是全国排名前十的大学，医学实力在全国都是前五的。复旦大学上海医学院和重庆医科大学有很深的历史渊源。1955年，上海第一医学院(现复旦大学)400多名教职工迁至重庆，成立重庆医学院(现重庆医科大学)。这也是为什么重庆医科大学选择了东部的复旦大学，而不是附近的四川大学。
总的来说，重庆医科大学目前实力非常不错。是教育部、国家卫生健康委员会和重庆市共建的全国重点医科大学。是国家重点扶持的西部十四所高校之一。拥有4个国家重点学科，7个博士后科研流动站，7个一级学科博士点，2个国家级教学团队。
复旦大学的临床医学和基础医学实力比较强，重庆医科大学的王牌学科也是临床医学和基础医学。因此，复旦大学应以自身的学科优势，重点支持重庆医科大学的王牌学科，帮助重庆医科大学尽快获得A类学科，帮助其进入世界一流学科建设大学行列。
相信在不久的将来，这两所实力雄厚的医科大学的合作，一定会帮助重庆医科大学更上一层楼，早日进入国内一流大学的行列。
