学校现设有以下院系：
制药工程系、食品系、药学系、经营管理系、中药系、医疗器械系、健康管理系
1、山东药品食品职业学院专业设置情况| 序号 | 专业名称 |
| 1 | 药物制剂技术 |
| 2 | 生物制药技术 |
| 3 | 化妆品经营与管理 |
| 4 | 药品质量与安全 |
| 5 | 药学 |
| 6 | 药学（校企合作） |
| 7 | 医学检验技术 |
| 8 | 食品营养与检测 |
| 9 | 食品质量与安全 |
| 10 | 餐饮管理（校企合作) |
| 11 | 药品经营与管理 |
| 12 | “3+2”专本贯通 |
| 13 | 食品药品监督管理 |
| 14 | 中药学 |
| 15 | 中医养生保健 |
| 16 | 医疗器械维护与管理 |
| 17 | 医疗器械维护与管理（校企合作） |
| 18 | 医疗设备应用技术 |
| 19 | 医疗器械经营与管理 |
| 20 | 精密医疗器械技术（校企合作） |
| 21 | 物流管理（校企合作) |
| 22 | 护理 |
| 23 | 健康管理（校企合作） |
| 24 | 技师合作（中药专业） |
来源于2020年山东药品食品职业学院山东省普通高职招生计划
3、山东药品食品职业学院比较好的专业名单《高等职业教育创新发展行动计划（2015—2018 年）》项目认定骨干专业：中药学、医疗器械维护与管理、药学、药品经营与管理
4、学校简介山东药品食品职业学院是经山东省人民政府批准，由国家教育部备案的一所专科层次的全日制公办普通高等学校。
山东药品食品职业学院始建于1958年；1980年12月，更名为山东省医疗器械技工学校；1983年12月，更名为山东省医药工业学校；1999年7月，更名为山东省医药学校；2005年4月27日，经山东省人民政府批准，升建为山东药品食品职业学院。
