2021年度山东省省属高校除正常办学经费拨付外，另一大项就是省教育厅各类专项经费的支持，其中主要包括（1）“双高”建设工程（即高水平大学和高水平学科），年度总经费16.275亿；（2）高水平应用型大学建设工程，年度总经费7.7亿；（3）公费医学生培养计划，年度总经费5693万元；（4）科教融合专项经费，年度总经费12.45亿元。2021年度省教育厅上述4类专项经费共计资助47所高校，其支持力度排名如下（单位：亿元）：其中山东第一医科大学获得近11亿元的专项资助，位列省属高校第一位，其中有10亿元来自于科教融合专项经费。齐鲁工业大学获得3.45亿元专项资助，位列省属高校第二位，其中有2.45亿元来自于科教融合专项经费。上述两所高校也是本年度科教融合专项经费资助的仅有的两所高校。除山东第一医科大学、齐鲁工业大学这两所省属“试点”高校之外，青岛大学获得的专项资助尤其是“双高”建设工程专项资助额度最大，达到1.66亿元；山东农业大学紧随其后，达到1.63亿元。另外山东师范大学（1.465亿）、济南大学（1.33亿）、山东科技大学（1.23亿）和山东中医药大学（1.05亿）也都达到了1亿元以上。上述8所高校将是未来一段时间，山东省省属高校建设的重点。另外，值得一提的是，2021年度山东协和学院、潍坊科技学院和齐鲁医院学院等三所民办高校也获得了部分省教育厅专项资金资助，额度分别达到了920万元、500万元和110万元。总的资助范围达到了47所高校，其中41所公办本科院校、3所民办本科院校和3所公办专科院校，覆盖面还是比较广的。资助额度最低110万元，最高近11亿元，充分体现了范围广但梯度明显的特点。
