根据《安徽省新冠肺炎疫情防控应急综合指挥部办公室关于进一步做好秋季学期开学师生返校疫情防控工作的通知》要求，为保障新学期师生返校后的生命安全，在马鞍山市疫情防控部门的统一安排下，皖江工学院分批次在两个校区开展秋季学期返校后核酸检测工作。
9月7日，学校在马鞍山市郑蒲港新区疫情防控办的指导下，精密组织、有序部署检测工作，从早上10:30开始，对全部郑蒲港校区返校师生进行核酸检测。
9月10日，学校霍里山校区全体师生员工、学校后勤人员、务工人员、教师公寓入住的教职工家属等人员，戴好口罩、携带身份证件，按照学校发布的霍里山校区《全员核酸时间安排表》通知，有序前往核酸检测点。
9月11日至12日，皖江2021级新生入校报到。在报到后的第二天，9月13日，郑蒲港校区就组织开展了新生核酸检测工作。
截止9月13日，皖江工学院霍里山校区已检测11386人，郑蒲港校区已检测4585人，采集核酸样本15971份。9月15日检测结果显示，所有人员均为阴性。
