首都体育学院与北京体育大学的区别有三点：
第1点：两个学校所隶属的级别不同。
首都体育学院是属于北京市级别的学校，是北京唯一的一所高等体育院校。而北京体育大学是全国性重点院校，是国家级别的，属于国家“211工程”的重点建设大学，隶属国家体育总局。被国家选为首批“双一流”建设名校。北京体育大学创办时间久，有深厚的文化底蕴和扎实的办学基础和师资力量，还有光荣的办学历史。北京体育大学声名是享誉国内外的。
第2点：两者成立的时间不同。北京体育大学成立于1953年，早年的名字叫“中央体育学院”，后来经过不断的发展，从院校发展到大学，成为培养本科学生的重要地点。而“首都体育学院”创建时间比北京体育大学晚三年，后来经过几次改名之后，由国家教育局批准更名为“首都体育学院”。
第三，对于博士培养方向不同。首都体育大学经过不断发展，最后确立为为国家培养特殊需求的博士人才培养项目的单位。因此首都体育大学开始独立培养博士学位研究生。北京体育大学是以本科教育为基础，研究生教育为重点。拥有培养博士的方向和硕士学位的种类比较繁多。
