生物工程专业的本科生直接从事科研的可能性不大。部分毕业生转向其他行业，部分毕业生从事相关专业的下游技术工作。
生物学是一门涉及面很广的学科，与许多学科紧密交叉，并与之结合产生了生物医学、生物制药、生物信息学、食品科学与工程、海洋生物科学、生物工程、分子生物学、基因工程等许多边缘专业。所以很多高校的生物系下面，除了生物科学、生物技术，还有其他专业，比如制药工程、医学工程。
接收生物科学专业毕业生的主要单位是各类生物制品公司，大部分是生物制药、饮料食品、保健品企业；其次是环保生态部门，但是吸收不是很大。学生在申请生物科学专业时，可以尽量选择品牌较好的院校。在就业形势没有明显扭转的情况下，好品牌的优势是很明显的。但是一旦进入普通院校，也可以准备辅修双学位。
从就业方向看，生物科学专业的学生毕业后可以到科研机构或高等院校从事科研或教学工作，也可以到工业、医药、食品、农林牧渔、环保、园林等行业的企事业单位和行政部门从事与生物技术相关的应用研究、技术开发、生产管理和行政管理工作。此外，生物科学专业的科技含量更高，因此该学科的学生有必要选择继续深造，以利于其未来的专业科研。
地域差异是生物科学专业不可避免的问题，前端科技的发展一直基于经济实力和实际需求。但是，这些条件在大城市和小城市之间差别很大。大城市经济的快速发展和不断增加的新需求为职业发展提供了动力和可能。中小城市在这方面的发展相对较慢。据统计数据显示，80%以上正在求职的生物科学专业学生选择在北京、上海和重要省会城市工作，并认为留在大城市会为自己的专业和未来的个人发展提供更多的机会。如果去基层，不仅工资低，而且提升的机会也不大。
