重庆医科大学由上海第一医学院(现复旦大学上海医学院)创建于1956年，前身为重庆医学院。
是国务院学位委员会批准的首批具有博士、硕士学位授予权的单位，教育部批准的首批来华留学示范基地。2015年，学校成为重庆市人民政府、国家卫生和计划生育委员会(原国家卫生计生委)、教育部共建高校。2020年成为“学术创新引智计划”(简称“111计划”)首批设立的地方高校之一。
学校由渝中区袁家岗校区和重庆大学城缙云校区组成，校园总面积2650亩。其中缙云校区占地2100亩，校园环境优美，风景如画。
全日制在校生25760人，其中研究生5740人，本科生19310人，留学生710人。学校有资格招收博士后研究人员、港澳台学生和外国留学生。
重庆医科大学有7个一级学科博士学位授权点，12个一级学科硕士学位授权点，3个博士学位授权点，11个硕士学位授权点。国家重点学科4个，ESI世界前1%学科4个(柯睿卫安2020年3月发布)，重庆市一级学科4个，“十三五”重庆市市级重点学科12个。在教育部学位中心第四轮学科评估中，临床医学等学科位居全国前列。
这所大学有21个学院(系)和一个研究生院。开设34个本科专业。重庆市“三个专项行动计划”专业12个，重庆市“三个专项行动计划”专业群6个。临床医学通过国际临床医学专业认证，口腔医学和护理通过教育部专业认证。现拥有国家级实验教学示范中心4个，国家级精品资源共享课程4门，国家级精品视频公开课3门。
目前拥有“973”计划首席科学家2名，国家千人计划专家7名，长江学者6名，国家千人计划人选9名，以及国务院政府特殊津贴获得者、卫生部有突出贡献中青年专家、国家杰出青年科学基金、国家杰出青年科学基金、教育部新世纪杰出人才。现有教师2220人，其中高级专业技术人员1340人。博士生导师239人。有五个博士后研究流动站。
重庆医科大学生命科学研究院医科大学坚持自主创新，科研能力和水平不断提高。“十二五”以来，他们率先承担了国家科技重大专项、国家重大科研项目、国家RD重大项目、国家重点基础研究发展计划(973计划)、国家高技术研究发展计划(863计划)、国家科技支撑计划、教育部新世纪人才计划、国家自然科学基金项目等。获得各类科技成果奖励120余项，其中国家科技进步二等奖3项，重庆市科学技术奖、中华医学科技奖等省部级奖励60余项。学校自主研发的高强度聚焦超声肿瘤治疗系统(海扶刀)为世界首创，是我国第一台具有完全自主知识产权的大型医疗设备。
目前，高校拥有国家级和省级研究机构44个，其中国家工程研究中心1个，国家生物产业基地实验动物中心1个，国家国际科技合作基地1个，教育部重点实验室3个，教育部国际合作联合实验室1个，教育部共建国家重点实验室培育基地1个，省级工程研究中心5个，省级重点实验室23个，重庆市国际科技合作基地1个，重庆市临床医学研究中心6个，省级人文社会科学基地1个。此外，还有省级“海外高层次人才创新创业基地”和“院士专家工作站”。
重庆医科大学实验中心重庆医科大学积极开展国内外交流与合作。近年来，学校与欧洲、亚洲、北美、大洋洲20个国家和地区的44所教育或医疗机构建立了合作关系，包括美国达特茅斯学院、加拿大不列颠哥伦比亚大学、英国伦敦大学学院等。广泛开展师生交流和国际科研合作。同时与复旦大学、华中科技大学等“双一流”建设高校开展长学制医学生联合培养。
目前有9所附属医院(综合医院5所，儿童医院1所，口腔医院1所，康复医院1所，中医院1所)。附属第一医院、附属儿童医院、附属第二医院连续六年入选中国最佳医院百强(复旦大学医院管理研究院发布)，2020年分别排名第52、58、93位。直属附属医院拥有28个国家临床重点专科，床位1.1万余张，年门诊量1035万人次，住院病人40万人次。此外，重庆、四川、深圳还有20家附属医院，30家教学医院。
