2021年5月15日，第三方专业科技成果评价机构——中科合创(北京)科技成果评价中心在昆明依据科技部《科学技术评价办法》的有关规定，按照科技成果评价的标准及程序，本着科学、独立、客观、公正的原则，组织专家对云南农业大学牵头完成的“云南特色药食同源植物基因组及品质性状机理研究”项目进行了科技成果评价。
此次成果评价专家委员会由中国科学院院士、中国科学院昆明植物研究所研究员孙汉董，中国科学院昆明植物研究所研究员孙航，广西药用植物园研究员缪剑华，中国热带农业科学院副院长、研究员刘国道，吉林大学教授付学奇，浙江茶业学院执行院长、教授级高级工程师张士康，云南大学研究员李庆军等专家组成。
经过专家评审，认为该项目立足云南丰富的药食同源特色植物资源，以基因组图谱绘制为切入点，实现从基因组到品质性状解析全过程的贯穿，创新点如下：首次在植物基因组图谱绘制中引入三代测序平台，创新了二代、三代测序混合组装技术，成功解析了铁皮石斛高复杂基因组，绘制了高杂合度基因组精细图谱，从基因组层面阐明其功效物质多糖和生物碱的合成和积累过程，引入代谢组思路系统，分离并鉴定了石斛素S等功效物质，揭示了其在抗肿瘤中的作用机理；完成八倍体植物玛咖基因组的解析，提出“植物通过基因组多倍化适应海拔快速抬升”，揭示了植物高海拔适应特征的遗传机理，为其他药食同源植物新资源的品质保证提供理论依据；解析并更新了三七基因组图谱，对云南三七产业提供了强有力的数据支持，拓展了三七的综合利用价值，为三七基因组辅助育种和三七皂苷生物合成提供了理论指导；完成和整合了特色药用植物跨组学数据，创新性提出了药用植物4.0研究计划，构建了“药用植物基因组数据库”，为药食同源植物资源创新与产品创制提供重要支撑；搭建了5个省部级创新研发平台，培养研究生40余人。本成果发表学术论文40余篇，其中影响影子大于10的有11篇，在药食同源植物研究领域形成了鲜明的特色，促进了相关物种的基础研究和产业化，为特色植物资源开发提供了基础数据和新思路。项目总体达到国际领先水平。经专家组全面审核，与会专家一致同意，“云南特色药食同源植物基因组及品质性状机理研究”项目通过科技成果评价。
