沈阳农业大学现有国家一级重点学科3个，分别为作物栽培学与耕作学、蔬菜学、土壤学；农业部重点学科3个，分别为土壤学、蔬菜学、植物病理学。一级学科博士点10个，学科评估前十名4个。尽管是“双非”普通农业大学，确有两名专职执教的中国工程院院士（院士李天来和院士陈温福），可见其师资力量雄厚、学术水平相当高。在两位院士的带领下，沈阳农业大学园艺和农学专业毕业的学生，就业形势非常好，每年考上本校和985、211重点院校的研究生非常多。其它专业如植物保护、农业机械化及自动化、农业工程、食品科学与工程、林学、农业资源与环境、农林经济管理等也是沈阳农业大学的优势专业也深受欢迎。
近年来，沈阳农业大学坚持以立德树人为根本，以服务国家需求和地方经济发展为导向，以提高研究生培养质量为核心，科学构建了研究生培养质量保证和监督体系，严把研究生入口关、培养过程关、出口关。从2015年开始，按照《普通高等学校学生管理规定》及辽宁省教育厅相关要求分三批对因学业成绩未达到学校规定要求，以及在学校规定的修业年限内未完成学业的研究生予以退学处理，截至目前共清退超期研究生236名，其中硕士研究生119名、博士研究生117名，至此超期研究生全部实现“清零”，“严管严出”举措收到良好效果。据校友会中国大学评价研究报告显示，2020中国大学700强中，沈阳农业大学排名第161位，与2019年排行的第197名相比，排名提升36位。2020年，沈阳农业大学在全国40个农林院校中排名第16名；在省内41个院校中，排名第6，沈阳农业大学呈现良好的发展势头！
沈阳农业大学力度空前的研究生“严出”作法引起良好的社会反响，为他们的作法点赞！
