成立1953年的中国人民解放军军事工程学院，由于校址在哈尔滨，所以又被称为哈军工。这所学校建立之初由陈赓大将担任首任院长，目的是打造成类似于黄埔军校之类的军事院校。但是这所高规格的高校仅仅成立17年之后便烟消云散，众多的院系纷纷并入其他高校。拥有哈军工血脉的高校有3所985包括国防科技大学，西北工业大学，哈尔滨工业大学，另外211层次的高校有南京理工大学和哈尔滨工程大学，另外还有7所军事院校也拥有哈军工的血脉！但是哈军工的主脉到底是哪所高校呢？哈尔滨工程大学还是国防科技大学？
1960年中苏关系骤然恶化，黑龙江省有成为前线的可能性，所以在1960年至1962年，哈军工分拆出众多的院系，这些院系大多成为了军校。其中炮兵工程系迁往湖北武汉，整合了武昌高级军械技术学院，成立了炮兵工程学院，不久之后迁往南京发展成为现在的南京理工大学，南京理工大学现在是211高校、小985高校、国防七子之一。
其他的院系分别成为装甲兵工程学院、解放军理工大学工程兵学院、防化指挥工程学院这3所嫡系高校，另外的一些院系分拆到其他各大高校，只是成为别人学校的一个系或者学院，并非主体。
经历过这次拆分之后，哈军工的实力虽然受到一定影响，但又重新组建了其他的院系。1966年由于一些因素的影响，哈军工退出了军队系列，更名哈尔滨工程学院。
1969年由于中苏珍宝岛事件的爆发，哈尔滨工程学院被迫分散南迁。1970年哈军工导弹工程系、电子工程系、计算机工程系以及院直机关内迁长沙成立长沙工学院，成为国防科技大学的前身。从这一方面来讲，国防科技大学因为有院直机关，所以是争夺哈军工嫡传地位的重要杀手锏。
哈军工二系原子工程系，是哈军工最好的最尖端的系，交给了哈尔滨工业大学。不过在1970年哈尔滨工程学院（哈军工）原子工程系和哈尔滨工业大学的尖端专业合并，西迁重庆北碚定名为重庆工业大学，定名为重庆工业大学，校舍使用的西南师范学院的。不过这个重庆工业大学比较奇葩，成立之后一直没有招生，1973年这所重庆工业大学又迁回哈尔滨和哈尔滨工业大学进行合并，原子工程系调回长沙工学院，交给了长沙工学院，也就是现在的国防科技大学。现在的哈尔滨工业大学基本上没有哈军工的血脉。
哈军工的空军工程系交给了西北工业大学。但是哈军工给他的空军工程系只是个雏形，真正的发展还是西北工业大学自己发展出来的，所以在西北工业大学的校史中，哈军工所占的分量极小。
哈军工海军工程系原计划前往武汉，但是由于种种原因，海军工程系留在了哈尔滨，组建了哈尔滨船舶工程学院。1970年的哈军工并没有全部南迁，大约有800名教职员工在哈尔滨成立留守处，依靠着一部分力量，成立了哈尔滨船舶工程学院。1994年学校更名哈尔滨工程大学，这次更名明显是继承哈尔滨工程学院，毕竟这是哈军工曾经使用过的校名，并且哈尔滨工程大学使用的是哈军工的老校区，所以也有资格继承这个名称。
1978年长沙工学院更名国防科学技术大学重新成为军校，对于本身就是军校的哈军工来说，相当于实质上继承了原来的哈军工，并且也是当时学校的院直系统也是迁到了长沙，并且是985高校。
1994年升格大学的哈尔滨工程大学，论级别比不过国防科技大学，但是也拥有哈军工的血脉，最重要的一点是继承了哈军工的老校区。
到底哪所学校是哈军工的嫡系继承者，这种情况类似于南宋时期孔氏宗族的分裂。国防科技大学相当于孔家南宗，而哈尔滨工程大学相当于孔家北宗，到底哪所学校是嫡系血脉，各位看官可以自行评判！
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