然后2006.7月转为正式职工

先申请仲裁，确认劳动关系，然后再要求补交社保或者赔偿。

关于职工权益的问题属于劳动局管辖，劳动工龄问题一般先咨询劳动局，也可以申请劳动仲裁或者直接起诉解决。