什么是16S rDNA基因序列分析

由于原核生物细胞中的16s rDNA和真核生物细胞中的18s rDNA的碱基序列都是十分保守的,不受微生物所处环境条件的变化,因此,通过分析比较微生物种之间16s rDNA和18s rDNA的同源性,可以真实的揭示它们的亲缘关系和系统发育地位。
16S中的"S"是一个沉降系数,亦即反映生物大分子在离心场中向下沉降速度的一个指标,值越高,说明分子越大。
rDNA 和rRNA中的小写字母"r"是ribosome(核糖体)的缩写。
rDNA指的是基因组中编码核糖体RNA（rRNA）分子的对应的DNA序列,也就是编码16S rRNA的基因。
rRNA指的是rDNA的转录产物,它是构成核糖体的重要成分,核糖体由许多小的rRNA分子组装而成,16S rRNA是其中一个组件。
一般所分析的对象都是16s rDNA,因为DNA提取容易,也比较稳定。
原核细胞的核糖体较小, 沉降系数为70S,由50S和30S两个亚基组成; 而真核细胞的核糖体体积较大, 沉降系数是80S, 由60S和40S两个亚基组成。在完整的核糖体中,rRNA约占2/3, 蛋白质约为1/3。50S大亚基含有34种不同的蛋白质和两种RNA分子,相对分子质量大的rRNA的沉降系数为23S,相对分子质量小的rRNA为5S。30S小亚基含有21种蛋白质和一个16S的rRNA分子。