已方违约要退还本金如何处理?

我是甲方公司.委托已方维修一台高压电机.双方签订了维修合同.设备修复后,双方鉴定验收.乙方提交检测合格报告.甲方投入运行13天后,设备原维修部位再次发生故障并扩大化.按合同要求,设备维修后有质量问题乙方免费修理.乙方认可责任.但要求主机全部维修并要求甲方负担一半的费用.否则退还先行预付的维修金.甲方不同意.请问:如何解决纠纷?