请问法律有規定门诊部的医疗费不可报销吗

我在上班时间內受伤，经劳动局确认为工伤，因事发急時选距公司进的门诊就医（公司沒有指定医院），沒有在社保指定医院就医，現公司认为是各人原因，导致医疗費无法在社保局申请，医疗费需各承担一半，请问法律有規定门诊部的医疗费不可报销吗？另外這种劳动纠纷要如何处理？公司有权这样处理吗？