1加班费能否要回2被扣工资可以要回吗

我去年8越与单位签了5年合约，约定有5000违约金。我们公司实行打卡制度，中午12点到下午2点是个人时间，但是我们从去年12月开始到今年8月份经常性中午加班，有证明，加班费从未支付。而且，由于我们8月份的工资下个月才发，今年9月我请假一个月，在这个月中扣了我一半工资，本人事后才知情，并因此引发辞职。