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你好：土地作为不动产是以登记为准，你既然已经办了证，土地使用权就是你的了，即使土地使用权证不在你手里也不会改变这个事实，除非国家因你闲置土地经过合法程序收回，否则公司无权对你购买的土地使用权作任何处分。租房与土地使用权转让是两个不同的合同关系，相互之间没有影响。建议你最好协商解决，如对方没有诚意，你可以向土地管理部门挂失土地使用权证，重新办个证，当然，房租还是要付的。

关键是你购买地皮的行为是否合法。如果是国有土地使用权可以依法转让，如果是集体土地使用权则不能转让。前者按合同执行。后者合同无效。