是行政扣押还是证据保存

车辆运输泥石在国道上，国土局以涉嫌参予非法采矿行为，将车泥一起扣押到镇派出所停放，从13日到20日后没有证据证明参予非法采矿给予放行，后起诉到法院，法院依照行证处罚法第三十七条：调查取证时，在证据可能灭失或以后难以取得的情况下，报行证机关领导批准，可以暂时保存的规定，认定是证据保存而不是行证扣押，对扣押期间的损失不给赔偿，请问：运输车经过公安车管部门登记并取得营运许可证，是属于证据灭失或以后难以取回的证据吗？这样的行证行为是否合法，该不该赔偿扣押期间的损失。