我现向他讨回证是否合法

2003年7月，本人加入xx公司，于在2006年参与了资格证评审，并在2006年12月30日取得了资格证（简称职称证），可是，去人事局领证的却不是本人，而是XX公司，从那刻至今，该证都被扣押在XX公司，2006年9月30日本人离职。考证和评审的全部费用由我所有。考试时间都是国家统一假日。公司无任何培训科目。 2008年10月28日下午，在跟xx公司人事部负责人多次交涉无果后，我到该区的劳动与社保局信访部正式投诉扣证事宜。 信访部提出XX公司应归还证给我，而XX公司负责人表示11月7日给回复。但7日并未见回复。于是，本人致电xx公司负责人，她表示我有三个选择：（1）交1000元赔偿金，给予退还证件；（2）职称证留存公司三年（依据一份协议，协议见附）；（3）仲裁。