我违约赔偿么

我与北京一公司今年5月份签订了一份非正规文本的劳务输出协议合同，到安哥拉打工做工长管理人员，在施工4个月后患上了非洲特有的虐疾病，在治疗后出现心律失常和失眠等症状，不能在正常工作，经过医生鉴定为疟疾并发症，恐病情加重，特此申请回国治疗。公司同意。可是公司要我赔偿合同违约的全部或者部分机票的费用，请问我应该赔偿么？如何保障我的合法权益？请解答谢谢！