工伤后公司只让保险公司报了部分费用，说有部分属自费药，不给报，我该咋办

应该由用人单位来承担。即使有保险也不能免除单位的责任。可以申请劳动仲裁。

你所称的保险是商业保险，由保险法来规范。同时可享受工伤保险待遇。