关于终止解除劳动合同的问题

我司是一个集团公司的下属公司，现我司有员工要辞职，在员工递交辞呈的当月，我司便停发了其工资。以前的操作是，我司将该员工的辞职申请上报给集团人事处批，批复下来之后才开具《终止解除劳动合同通知书》。但集团那边经常要拖上几个月才能批下来，这样的话，我司就要为此员工多交几个月的保险，且因停发工资，该员工的个人部份也要单位来垫付，只有等到员工来办理档案和劳动关系转移时让其退还这部份保险费。我司领导觉得这样做很麻烦，于是要求我们在停发其工资的同时就开具《终止解除劳动合同通知书》，以便到社保办理停保手续。请问在未得到批复前就开具《终止解除劳动合同通知书》是否合法，会不会引起纠纷？如果员工一直不来办理转移手续，那我司就一直收不回为其垫付的保险费用，该如何处理较好，请指教。