如何向运输公司索赔

我朋友的贸易公司经营化学产品，在今年的六月，他委托一家运输公司运输两车化工产品到一家企业，在运输途中，运输人员见财起意，盗窃了部分化工产品，并在剩余的化工产品中掺了水，第一车由于企业检验时没注意就按合格产品验收了，到生产中才发现产品质量问题，造成了严重损失，那家企业考虑到和我朋友已经是多年合作关系，当时没和我朋友说明这个情况，于是就让我朋友发第二车货，想验证一下是不是运输中出的问题，结果第二车货到企业后经检验发现了问题，当时就报了警，警方依法传唤了驾驶员（这两车货是同一辆车，同一个驾驶员和押运员送的，报警后那个押运员逃跑了），驾驶员百般抵赖，到法定传唤时间满也没有招供，只好放了他，后来运输公司派人过来处理这件事，我们才了解这台车是挂靠在运输公司的，在处理中，我朋友和运输公司派来的那台车的车主先达成了第二车产品的赔偿协议，但双方对第一车货造成企业的重大损失赔偿一事存在很大差距，一直没有谈拢，到现在运输公司一直没有直接和我朋友谈过，只是让那个很穷的车主来谈，根本没有诚意解决，和那家运输公司老板联系，那个老板就推脱说车辆是挂靠的，出事和公司没关系，有车主自己解决，现在那家企业已经向我朋友公司进行索赔50万元，请问这个损失我朋友如何向运输公司索赔