我该如何维护我的权益

我2000年买的现在的房子,是那种县城自己买的土地盖的那种,但房子分了两部分,一部分是他的另一部分是他儿子的,两个房产证两个土地证,但当时协议上没有他儿子的签字,当时他儿子还在上学,没有分开过,现在土地证已经过户到我的名下,而房产证当时房管局给我办的初始证,而且他原来的证也已经盖了作废章.现在他通过关系到房管局把他的作废本调出来复印,告我们侵权.但我并不知道房管局给我办的是初始本.我现在不知道该如何是好.他现在想把房子要回去.请连律师给我指条明路.