寻求律师指点

在04年时向外地一工厂购买了一批货物,在支付了10%预付款后,收到对方发票并入帐,过几个月货物生产好发过来发现有部份货有较严重的质量问题,经协商,对方口头同意7折处理,因此我方在05年1月份按口头协议支付了货款.其后双方没有任何往来,直到08年4月对方又提出要支付打折部份的货款. 因没有书面的协定,我方是否可用已过两年诉讼期来反驳?还有对已做帐的发票是否要退回去?