请教有关诉讼时效的问题

急！有关诉讼时效的问题。。。 2003年8月我在1-4楼统一扩建住房的基础上新扩建阳台时，为施工将四楼住户已先扩建好的阳台上新加的卫生间的排污管锯断，2006年2月四楼住户将我告上法院，一审判我立即接通排污管，我不服上诉，2006年11月2日二审开庭后我才想起该诉讼从2003年8月-2006年2月应该已超过两年的诉讼时效。现请问律师：诉讼时效该如何计算？该案是否存在超过诉讼时效的问题？一审判决是否有效？就诉讼时效问题我是否应在二审判决之前向二审法院正式提出，如要的话该如何提出，要否提交有关证据？谢谢解答！