认定为工伤却得不到工伤死亡待遇怎么办

事情是这样的：年初我的父亲在上班路上发生严重车祸是脑部损伤，基本上是植物状态维持了四个月就去逝了。事故出现后两个月我们与肇事方在交通队达成了赔偿协议。由于是在上班路上发生的车祸，其所在单位也申请了工伤认定（单位上了工伤保险），四月底劳动局认定为工伤（由于其单位人员的疏忽认定结果我们是八月份才拿到的），但是当时五月初还没有申请劳动能力鉴定我父亲就去世了。关于工伤赔偿劳动局给的答复是事发48小时内死亡的才能算是工伤死亡赔偿，按工伤负伤算又没有鉴定，再加上肇事方已经赔偿了所以工伤保险没有赔偿，这种解释有根据吗？像这种情况该怎样处理？还有就是医药费的问题，是否应该全部报销?当时在与肇事方达成协议之前他们垫付了全部医药费(这部分在赔偿中扣除了),这部分医药费是否可以由工伤保险报销?之后的医药费是在我父亲去世时由所在单位垫付的,这部分其单位说工伤保险报销了。我父亲的死在实时上是工伤造成的，却为什么无法落实工伤保险待遇？我知道这种人身伤害牵扯民事第三者已经赔偿，工伤保险要赔偿很难。我还是想尽量搞清楚，不管有没有赔偿我需要一个明确的说法。奔波于劳动保障局、工伤认定处及单位之间我却越来越无所适从。请各位帮帮我吧，我该怎么办？