请问这样做允许吗

具体情况具体分析，如果其管理方案确实侵犯了A公司的权利，可以起诉。

根据公司法的规定，由公司股东会批准公司的利润分配方案及决定董事的报酬，由公司董事会决定经理报酬，当然如果章程由例外规定的除外。就你所说，B公司共四个股东，设有执行董事，那就应该没有董事会，董事会的职权由执行董事具体执行。那么身兼执行董事的总经理有权决定公司经理的报酬事项，如果A公司欲改变此不利局面，有两种方式：如A公司控股B公司，可变更执行董事，另派人担任。如非控股，当然可以通过诉讼方式解决，但诉讼中可能面临举证不利的局面，新公司法出台后很多程序性的保障措施及解释并没有出台，目前在操作上可能有一定的难度，建议慎重处理。有关依据：《公司法》第三十八条　股东会行使下列职权：　　（一）决定公司的经营方针和投资计划；　　（二）选举和更换非由职工代表担任的董事、监事，决定有关董事、监事的报酬事项；　　（三）审议批准董事会的报告；　　（四）审议批准监事会或者监事的报告；　　（五）审议批准公司的年度财务预算方案、决算方案；　　（六）审议批准公司的利润分配方案和弥补亏损方案；　　（七）对公司增加或者减少注册资本作出决议；　　（八）对发行公司债券作出决议；　　（九）对公司合并、分立、解散、清算或者变更公司形式作出决议；　　（十）修改公司章程；　　（十一）公司章程规定的其他职权。 第四十七条　董事会对股东会负责，行使下列职权：　　（一）召集股东会会议，并向股东会报告工作；　　（二）执行股东会的决议；　　（三）决定公司的经营计划和投资方案；　　（四）制订公司的年度财务预算方案、决算方案；　　（五）制订公司的利润分配方案和弥补亏损方案；　　（六）制订公司增加或者减少注册资本以及发行公司债券的方案；　　（七）制订公司合并、分立、解散或者变更公司形式的方案；　　（八）决定公司内部管理机构的设置；　　（九）决定聘任或者解聘公司经理及其报酬事项，并根据经理的提名决定聘任或者解聘公司副经理、财务负责人及其报酬事项；　　（十）制定公司的基本管理制度；　　（十一）公司章程规定的其他职权。 第二十条 公司股东应当遵守法律、行政法规和公司章程，依法行使股东权利，不得滥用股东权利损害公司或者其他股东的利益；不得滥用公司法人独立地位和股东有限责任损害公司债权人的利益。　　公司股东滥用股东权利给公司或者其他股东造成损失的，应当依法承担赔偿责任。　　公司股东滥用公司法人独立地位和股东有限责任，逃避债务，严重损害公司债权人利益的，应当对公司债务承担连带责任。

经理只是高级打工者,分配等重大问题需要老板拿主意。

要看其是否有权这样做;A公司作为股东,有权起诉

总经理没有单独决定分配的权利。