告我侵权被立案，我难明白

2000年与湖北咸宁学院签了定向培养合同，03年9月毕业后由于种种原因，与院长谈过后，来到现在的单位工作。03年十一月户口迁入该市，05年4月收到原单位律师函，我提醒律师，原单位03年9月以后停发了我的工资。仲裁时效已过。但05年10月法院来函。对方以我和现工作单位侵权立案。我问过几个律师，都没讲明本应按《劳动法》过了时效的案子怎么又属于侵权了呢？我该如何应对？能指点我看哪些法律条款吗？