是否坚持劳动争议仲裁申诉

我于2005年6月1日向用人单位提交了辞职报告，然后就没有到单位上班，辞职报告中提出支付我业务提成要求，6月7日单位通知我去财务部办理清算手续，可是我所在部门经理通知财务说，我在部门尚有帐目没有结清，财务部就停止给我办理清算手续，我回到所在部门和经理交涉，我所在部门没有单独的资金帐户，又不存在借款和欠款问题，最后，就我业务提成问题，部门经理以货款未全部收回，只有等到货款收齐，才能支付。我当时指出，业务虽是我联系洽谈的，最终合同是有单位法人授权委托单位部门经理签订的，作为法人委托人应该对所签合同所有内容负责，造成货款拖欠是由于法人授权委托人没有严格履行合同，在合同对方违约的情况下，没有根据合同约定合同纠纷处理条款通过法律途径解决，货款未收回不是我的责任。为此产生争议，我想向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，可是，通过对劳动者提出辞职必须提前30天通知用人单位，在用人单位30日内未批准，可要求解除劳动合同，离开用人单位。我想申诉，又考虑到我提交辞职报告后就离开用人单位，可能要承担违约责任并支付违约金，我不知该如何办好？请朋友们指点解决办法，谢谢！