劳动合同终止、违约赔偿、档案关系转移

我1997年8月毕业分配到一家事业单位从事科研工作。当时未签定劳动合同，但后来从单位人事部门的文件上了解到，未签定劳动合同的，都是按5年服务期限对待； 2000年5月我购买了单位的公房，签了一份为单位服务8年的协议（未明确从何时开始计算）； 2003年9月，我受国家教委资助（非所在单位资助；但国内工资仍由单位照常发放），出国留学1年，又与单位签定了一份回国后服务5年的协议（有违约赔偿的说明，但未明确具体赔偿金额）； 2004年9月，我回到原单位上班。近日我打算报考在职博士研究生，但单位领导不同意。 我想咨询： （1） 我在2000年5月购买单位公房时签的服务8年的协议，是否可以理解为从我进所工作开始计算服务时间，即从1997年8月-2005年8月为服务期限？ （2） 如果我在2005年9月提出辞职，单位要求我赔偿费用，是否最多只能以我出国1年期间单位发放的所有工资总额为限？我是否可以只赔偿超出当地最低工资标准的部分？到时我已服务了1年，是否只需要赔偿剩余的80%（按5年为100%计算）？ （3） 如果我辞职，单位不同意，如何解决？如果单位扣留我的档案关系，是否违法？我可以通过哪些途径要求解决？ 急盼回复。谢谢。