关于“应届毕业生、试用期、违约金”的问题

本人是今年毕业的本科应届毕业生，现在在江苏省南京的一家公司上班，由于个人原因需要辞职，公司要我支付违约金，交涉了几天没有结果。 　　我与公司的合同上约定合同期从2004.8.1到2006.7.31，试用期三个月，同时在补充协议上还约定了服务期（时间期限和合同期相同）。 　　前几天我向公司提出辞职的时候，公司里说要交两万余元违约金（按补充协议上关于服务期约定的那条条款算出来的），我当即反驳说按照劳动法试用期辞职不用付违约金；然后公司又说毕业生没有试用期而只有见习期，我又指出合同上明明白白写的是“试用期”三个字；昨天公司改口了，说考虑到我可能拿不出两万，所以只要交五千（毕业生就业协议上约定的违约金数额）就行了，我想既然我来公司报到了，毕业生就业协议就应该无效了才对。