劳动合同问题

我的问题是，我是公司一职工。在项目期间，项目经理由于特殊原因请假2个星期，把工作交于我，由于工作量过大，我向公司申请辞职。 公司第一天同意我的辞职申请并签署了离职协议。而第2天再来公司时却又扣留我的失业证，社保等说我未提前30日申请辞职，算我违反合同约定。要赔偿违约金，并且在合同中并没有详细指明违约金具体数额。只提到“按国家有关规定给对方造成经济损失的，应依法承担赔偿责任”。（附：我签署的合同是有固定期限，但至今未满的）我现在不明白就是：双方既然已经同意并签署了离职协议，这算不算真正解除了合同。