但是我有第三责任险和机动车损失险，被撞的车不到保险公司指定地方修理要到4s店，中间的差价要我来赔吗

发生车祸后，如果双方对赔偿产生纠纷而对责任划分意见相同的，应该及时报警和向保险公司报案，由交警按简易程序出具责任认定，由保险公司对车辆损失（修理费）进行估价。