孩子有两个户口是农村户口，地址不同，姓氏也不同

到户籍部门确定，然后起诉就可以

户口问题一般归属公安系统的户籍管理部门管辖，作为公安局的派出机构，乡镇派出所也承担户籍管理的职责，如果遇到有关改姓名的问题，可以咨询户口所在辖区派出所的户籍管理科室。