该公司在广州注册，但该公司在花都，应在那里申请劳动仲裁

公司注册地、和实际工作地都可以申请劳动仲裁，只是选择实际工作地立案时稍有麻烦，你要提供相应的证据证明实际工作地

您好，可以去当地的劳动局提起劳动仲裁

劳动者同时向公司注册地、劳动合同履行地申请劳动仲裁的，由劳动合同履行地仲裁委员会管辖。